2000年9月13日に南極で発生したセカンドインパクトと呼ばれる大災害後の地球を舞台とする。その大惨事から復興しつつあった2015年の人類は、使徒と呼称される新たな脅威に見舞われていた。
国連の下部組織である特務機関NERV（ネルフ）は、襲来する使徒を殲滅するため、汎用人型決戦兵器人造人間エヴァンゲリオン(EVA)を極秘に開発していた。そのパイロットには、まだ14歳の多感な少年・少女が選ばれ、世界の命運を託されたのであった。
新世紀エヴァンゲリオン
- 第壱話 「使徒、襲来 ANGEL ATTACK」
- 第弐話 「見知らぬ、天井 THE BEAST」
- 第参話 「鳴らない、電話 A transfer」
- 第四話 「雨、逃げ出した後 Hedgehog's Dilemma」
- 第伍話 「レイ、心のむこうに Rei I」
- 第六話 「決戦、第3新東京市 Rei II」
- 第七話 「人の造りしもの A HUMAN WORK」
- 第八話 「アスカ、来日 ASUKA STRIKES!」
- 第九話 「瞬間、心、重ねて Both of You, Dance Like You Want to Win!」
- 第拾話 「マグマダイバー MAGMADIVER」
- 第拾壱話 「静止した闇の中で The Day Tokyo-3 Stood Still」
- 第拾弐話 「奇跡の価値は She said, "Don't make others suffer for your personal hatred."」
- 第拾参話 「使徒、侵入 LILLIPUTIAN HITCHER」
- 第拾四話 「ゼーレ、魂の座 WEAVING A STORY」
- 第拾伍話 「嘘と沈黙 Those women longed for the touch of others' lips, and thus invited their kisses.」
- 第拾六話 「死に至る病、そして Splitting of the Breast」
- 第拾七話 「四人目の適格者 FOURTH CHILDREN」
- 第拾八話 「命の選択を AMBIVALENCE」
- 第拾九話 「男の戰い INTROJECTION」
- 第弐拾話 「心のかたち 人のかたち WEAVING A STORY 2:oral stage」
- 第弐拾壱話 「ネルフ、誕生 He was aware that he was still a child.」
- 第弐拾弐話 「せめて、人間らしく Don't Be.」
- 第弐拾参話 「涙 Rei III」
- 第弐拾四話 「最後のシ者 The Beginning and the End, or "Knockin' on Heaven's Door"」
- 第弐拾伍話 「終わる世界 Do you love me?」
- 第弐拾六話 「世界の中心でアイを叫んだけもの Take care of yourself.」
